疏水层析介质的种类多种多样,其疏水性强弱主要受基质种类、配基种类及配基密度等诸多因素影响。上述因素也是选择层析介质的依据。
一般而言,具有良好机械强度、合适孔径和良好稳定性的各种琼脂糖均可作为层析介质的基质。
配基是影响疏水介质吸附选择性的决定性因素,常用的疏水配基有苯基、烷烃基(丁基、辛基等)、聚乙二醇、聚醚等,其中常用的是苯基、丁基(包括丁基硫)和辛基。当配基密度一定时,配基中含有的苯环数越多或配基的疏水链越长,介质的疏水性越强,蛋白质在疏水层析介质上的交换容量及保留值越大,常用配基疏水作用强弱的顺序为:Butyl< Octyl < Phenyl。
博进公司已开发出丁基及苯基两种系列的疏水层析介质。